Câu chuyện dựa trên truyện cổ Andersen. Một bà mẹ cô đơn luôn mong chờ có được một người con gái và rồi ước mơ của bà thành hiện thực khi một nữ phù thủy tốt bụng tặng bà một hạt giống. Bà trồng hạt giống đó, ngày hôm sau, khi hoa nở, có một cô bé đang nằm trong bông hoa, “chỉ bé bằng ngón tay cái”. Bà đặt tên cho cô là Thumbelina. Ngày ngày Thumbelina giúp mẹ làm vườn vui vẻ, nhưng luôn buồn vì chẳng có ai bé nhỏ như cô cả. Một tối nọ, mẹ cô kể cho cô một câu chuyện cổ tích và Thumbelina mơ ước mình sẽ tìm được người để yêu.