Chiến Đội Đặc Mệnh kể về câu chuyện mười ba năm trước, Phim Chien Doi Dac Menh hệ thống máy tính của Trung Tâm Quản Lý Năng Lượng đang kiểm soát nguồn năng lượng mới của con người là enetron đã bị tấn công bởi 1 vi rút máy tính có nhận thức như con người tên là Messiah.

Sự nguy hiểm của Messiah buộc Trung Tâm Quản Lý Năng Lượng lập nên chiến đội đặc mệnh từ 3 đứa trẻ có khả năng siêu nhiên sống sót sau sự cố tấn công của Messiah là Ryuuji, Hiromu và Yoko, trở thành Go Busters.